Large-scale mutational analysis uncovers molecular mechanisms governing dual RNA functions in transposons
该研究通过大规模突变分析揭示了 IS 转座子（IStron）中 RNA 结构稳定性是决定其转座、RNA 引导的 DNA 切割与自我剪接这三种功能之间权衡与选择的关键分子机制。
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molecular biology
376 篇论文
Structural basis for continuous DNA-end protection during ligation of double-strand breaks in yeast Non-Homologous End-Joining
该研究通过冷冻电镜解析了酵母中不依赖 DNA-PKcs 的非同源末端连接（NHEJ）复合物结构，揭示了 Dnl4 酶在微同源序列上通过交替结合模式实现连续末端保护与连接，以及在平末端上因非对齐构象导致连接受阻的分子机制。
HTLV-1-Induced Neuroimmunome Correlates with Disease Progression and Severity
该研究通过整合多组学数据，揭示了 HTLV-1 感染中由外周血白细胞介导的、与疾病进展和严重程度密切相关的神经免疫特征（神经免疫组），并鉴定出如 ATF4 和 SKIL 等潜在生物标志物，为理解该病毒致病机制及开发新靶点提供了重要依据。
Separating anorexia -dependent and -independent effects in cancer cachexia
该研究利用 C26 结肠癌模型阐明，厌食症虽是导致癌症恶病质中体重下降及脂肪肌肉流失的主要驱动因素，但并非导致体能下降的原因，因此区分厌食依赖性与非依赖性效应对于深入解析恶病质机制至关重要。
Ischemic stroke rewires the neuronal translatome via stress-induced stop codon readthrough, frameshifting, and codon-biased translation
该研究通过构建小鼠缺血性脑卒中的时序性核糖体图谱，揭示了卒中后翻译调控在超急性期表现为终止密码子通读和 GC 偏好性，而在 6-24 小时阶段则演变为广泛的阅读框破坏及 uORF 重塑等动态重编程机制。
Defying expectations: Extended lifespan and limited age-related telomere shortening in the tropical bat species, Molossus molossus.
这项基于巴拿马长期野外标记重捕研究的新发现表明，曾被认为寿命极短的热带蝙蝠*Molossus molossus*实际寿命可超过 13 年，且其端粒长度随年龄增长并未出现显著缩短，从而挑战了关于该物种寿命及衰老机制的传统认知。
A New Approach to Modeling LGMDR1: Pyrvinium-Treated capn3b crispant Zebrafish
该研究通过构建*capn3b*突变斑马鱼模型并结合 Wnt 信号通路抑制剂吡咯喹啉（pyrvinium）处理，成功模拟了 LGMDR1 患者的基因表达谱，为缺乏理想动物模型的该病提供了新的药物筛选与机制研究平台。
m6A-dependent microRNA binding to chromatin-associated RNA for transcriptional activation
该研究揭示了 microRNA 通过 m6A 修饰依赖的机制结合染色质相关 RNA，进而招募 FXR1/2、AGO 复合物及 SMARCA4 和 TET1 等因子重塑染色质并促进 DNA 去甲基化，从而在多种细胞类型中激活基因转录。
Characterization of aliA and aliB deletion mutants reveals a dominant role of AliA in Haloferax volcanii lipoprotein lipidation
该研究通过大规模蛋白质组学和脂质质谱分析，证实了古菌 Haloferax volcanii 中 AliA 是负责脂蛋白脂质化的主要酶，其缺失比 AliB 缺失更显著地影响了脂蛋白的疏水性及修饰，从而确立了 AliA 在该过程中的主导作用并推动了古菌脂蛋白生物合成机制的理解。
A Cooperative Mechanism of Eukaryotic Transcription Factor Target Search
该研究通过活细胞单分子成像揭示，真核转录因子（如 Gal4）无需依赖细菌式的“促进扩散”机制，而是通过内在无序区介导的协同自相互作用及结构域二聚化，在扩散极限内实现快速且高效的靶标识别。
The human GRK4Gamma griego minusculo 65L variant causes salt-sensitive hypertension by increasing renal SLC4A5 expression through the HDAC1 pathway
该研究表明，人类 GRK4γ 65L 变异体通过抑制 HDAC1 通路，上调肾脏中 SLC4A5 和 AT1R 的表达，从而导致盐敏感性高血压。
MEF2A is a negative regulator of β-Cell maturation and function
该研究揭示转录因子 MEF2A 是内质网应激诱导的β细胞功能障碍的关键负调控因子，其表达上调会抑制β细胞成熟基因并损害胰岛素分泌，而抑制 MEF2A 则有助于维持β细胞功能。
Analysis of Gene Expression Changes upon Topobexin Treatment and TOP2B-knockout in hiPSC derived cardiomyocytes
本研究利用 CRISPR-Cas9 技术构建 TOP2B 敲除的人诱导多能干细胞及其衍生的心肌细胞模型，结合转录组分析证实新型 TOP2B 选择性抑制剂 Topobexin 能有效模拟基因敲除表型，从而为研究蒽环类药物心脏毒性及筛选心脏保护剂提供了无需基因编辑的高效替代方案。
A novel subset of hepatocytes is simultaneously gluconeogenic and de novo lipogenic in the fed state and is naturally insulin resistant
该研究利用单细胞测序和空间代谢成像技术，发现了一种在进食状态下同时表达糖异生和从头脂肪生成基因且天然存在胰岛素抵抗的肝细胞亚群，这一发现挑战了传统认知并揭示了高脂饮食诱导胰岛素抵抗的新机制。
Microbial-derived D-lactate and LPS shape growth and inflammatory signalling in endometrial glandular epithelium
该研究利用子宫内膜类器官模型证实，源自微生物的 D-乳酸和脂多糖虽不改变细胞代谢活性，但分别通过调控上皮发育生长相关基因和炎症免疫信号通路，在激素诱导的容受状态下对子宫内膜上皮功能产生微妙的转录组学修饰作用。
No One-Size-Fits-All: An Evidence-Based Framework to Select Plasma EV Isolation Methods
该研究通过系统评估 11 种血浆细胞外囊泡分离方法，揭示了不同方法在囊泡亚群捕获、蛋白组覆盖度及污染物去除方面的差异，并据此提出了一个基于下游应用需求选择最佳分离策略的循证框架。
CRISPR screens establish regulatory maps of immunosuppressive surface molecules in cancer
该研究利用可诱导的 CRISPR 筛选技术绘制了多种免疫抑制性表面分子的调控图谱，并发现膜运输因子 DNAJC13 是 PD-L1 和 CD276 的关键调控者，其抑制可增强 T 细胞对癌细胞的杀伤力并延长胰腺癌小鼠的生存期。
KMT2C and KMT2D amplify GRHL2-driven enhancer activation
该研究利用急性诱导系统发现，先锋转录因子 GRHL2 虽能独立结合靶位点，但 KMT2C 和 KMT2D 作为关键共激活因子，通过促进组蛋白修饰和转录机器招募，显著放大了 GRHL2 驱动的增强子激活及基因表达。
TFU72 is a novel and potent DNA-PKcs inhibitor for enhancing homology-directed repair gene editing
该研究介绍了一种新型强效 DNA-PKcs 抑制剂 TFU72，它能将同源定向修复（HDR）基因编辑效率提升高达 30 倍，并通过缓解潜在的基因组毒性风险，为治疗和研究领域的精准基因编辑提供了安全高效的优化方案。
m⁶A-dependent FMRP control of DGKκ translation underlies core Fragile X phenotypes
该研究揭示了 FMRP 通过识别 m⁶A 修饰的重复 RNA 基序促进 DGKκ翻译，其缺失导致 DGKκ水平下降并引发脆性 X 综合征的核心病理表型，从而确立了 DGKκ作为该疾病关键驱动因子的地位。